caigui
Music
halo还是缺个好用的音乐插件啊，也许我可以学着做一个😊 (了解了一下，开发这个插件需要的技术栈我是一点也不懂🤦) 万能青年旅店 - 山雀 逃跑计划 - Is This Love 梁博 - 男孩
macos安装katago及图形化界面katrain
macos安装katago及图形化界面katrain 感受一下围棋AI brew install katago brew install katrain #好像只运行这一条命令也行，它会自动下载没有安装的katago？ # 在以下链接下载最新的神经网络 https://katagotraining
frp内网穿透
20250122.frp内网穿透 https://github.com/fatedier/frp https://service.oray.com/question/5571.html 1. 背景 背景来源于上述链接2 内网穿透，又称为NAT穿透。NAT背后的设备，它们的主要特点是 ，可以访问外网，
测试helixer通过深度学习注释基因组的效果
测试helixer通过深度学习注释基因组的效果 helixer，根据深度学习的方法来注释基因组。听说这个准确性很高，而且有很方便的在线版本，测试一下效果。 第一个链接上传即可, 134.6M的基因组文件上传后，大概不到两个小时就注释完毕了。 https://www.plabipd.de/helixe
github使用简单教程
github使用简单教程 # 克隆你 fork 的仓库 git clone git@github.com:CGsTree/citation_network.git cd citation_network # 创建并切换到新分支 cg git checkout -b cg # 修改🌟 # 将你
选择最快的R镜像
https://mp.weixin.qq.com/s/JzTVIRg0pHeHrdMMmGVaNw 速度越快，越节省生命。看到y叔一篇推文，详细记录一下。 1.镜像源设置的优先级 可以在home目录或者rstudio设置里，进行镜像源设置。 ~/.Rprofile 优于 Rstudio-tools-
给服务器某个页面加上密码
1. 前言 问了问ai，有3种方法，javascript，nginx，php。之前用的是javascript，但使用这种方法时密码明文是直接可以通过查看网页源码获得的，不长久，折腾一下，试试配置nginx的方法 2. 设置 # 添加用户并输入密码 sudo htpasswd -c /etc/ngin
ncbi_nr数据库blast
1. 数据库下载 # 下载nr数据库 # 原始fasta文件 https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/ # 构建好的db数据库（网络不好的话推荐下载这个，因为已经分成了很多小份，方便重新下载） # 推荐下载这个，因为还省去了重新makeblastdb
安装gitbook
1. 安装 sudo npm install -g gitbook-cli # 提示一下信息 # added 21 packages, and audited 579 packages in 9s # 54 vulnerabilities (1 low, 19 moderate, 24 hig
FastQ Screen检测测序数据污染情况
1.前言 检测测序数据中有无污染 2.安装及测试 https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastq_screen/ https://github.com/StevenWingett/FastQ-Screen mamba activate
在linux服务器挂载固态硬盘
在linux服务器挂载固态硬盘 有时候需要在linux服务器上挂载一个移动硬盘，来与服务器进行数据的传输。 1. 数据复制到目录中 # 连接移动硬盘到服务器主机上 # 查看移动硬盘的路径，类似于下面的/dev/sde2 sudo fdisk -l # /sbin/fdisk -l # 可以看到/d
使用华为云OBS下载测序文件
1. 前言 华为的obsutil简介:https://support.huaweicloud.com/utiltg-obs/obs_11_0001.html 华为的OBS Browser+简介:https://support.huaweicloud.com/browsertg-obs/obs_03_
文献阅读-20230705-维管植物中根毛发育基因的变化
与上一篇阅读的文献是相同的作者与通讯。 1. 背景 文章标题：Diversification of Root Hair Development Genes in Vascular Plants 发表时间：20170509 发表期刊：Plant Physiology 一作及通讯：Ling Huang(
文献阅读-20230704-多种植物中根系发育的保守基因表达程序
1. 背景 文章标题：Conserved Gene Expression Programs in Developing Roots from Diverse Plants 发表时间：20150811 发表期刊：The Plant Cell 一作及通讯：Ling Huang(上海交大本硕微生物，之后去
设置SSH免密码登陆
如果A想免密码ssh连接B，那么需要在A上操作，把A的公匙copy到B上。 另外，设置完成后，使用scp从A向B传输文件时也不再需要输入密码。 # 在实验室服务器上操作 ssh-keygen -t rsa #一路回车即可 # cat ~/.ssh/id_rsa.pub ssh-copy-id cai
在R中以markdown格式输出一个日程本
记事本如果不每天坚持使用，那么就没什么用了 --沃兹基硕德 # 创建一个从 2023 年 6 月 1 日到 2023 年 6 月 30 日的日期向量 dates <- seq(as.Date("2023-06-01"), as.Date("2023-06-30"), by = "day") # 使
给云服务器配置blast
给云服务器配置blast blast+（已放弃） cd wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.13.0+-x64-linux.tar.gz tar -zxvf ncbi-blast
在云服务器上部署JBrowse2
在云服务器上安装JBrowse2 文档：https://jbrowse.org/jb2/docs/quickstart_web/ 下载链接：https://github.com/GMOD/jbrowse-components 注：在本地docker中安装jbrowse失败了，目前我只能直接在服务器中
PHP_Web开发框架laravel部署
PHP_Web开发框架laravel部署 1. 安装laravel_docker # mac # 安装Docker Desktop cd ~/Database_in_Mac/08_caigui_site/04_laravel_docker curl -s "https://laravel.build
HiC数据处理之juicer
1. Try 安装juicer和3ddna。 建立fastq文件夹，cat分别合并 R1和R2测序文件。 建立reference文件夹，放入.fa文件，用以下命令进行预处理 mamba activate juicer mamba install -y bwa bwa index genome.fa