CaiGui's blog

Q：
推荐一些在“植物进化”，“动物进化”，“生命进化、起源”方面的高质量科普书

ChatGPT：
以下是几本关于“植物进化”、“动物进化”和“生命进化与起源”的高质量科普书推荐：

植物进化

1. 《The Emerald Planet: How Plants Changed Earth's History》
   作者：David Beerling
   探讨植物如何塑造地球环境，结合古生物学与植物学的视角。

2. 《Plants That Changed the World》
   作者：Chris Beardshaw
   讲述在人类历史中具有重要意义的植物及其进化过程。

动物进化

1. 《Your Inner Fish: A Journey into the 3.5-Billion-Year History of the Human Body》
   作者：Neil Shubin
   通过人类身体结构探索其动物进化起源，深入浅出。

2. 《Endless Forms Most Beautiful: The New Science of Evo Devo》
   作者：Sean B. Carroll
   聚焦进化发育生物学（Evo Devo），解析动物形态多样性的起源。

生命进化与起源

1. 《The Vital Question: Energy, Evolution, and the Origins of Complex Life》
   作者：Nick Lane
   探讨复杂生命起源的能量基础。

2. 《Life Ascending: The Ten Great Inventions of Evolution》
   作者：Nick Lane
   描述生命演化中的十个关键发明，包括DNA、性别和意识。

这些书籍结合科学研究和生动叙述，适合对生命和进化感兴趣的读者。

TAIR突变体表型汇总下载地址：https://www.arabidopsis.org/download/file?path=Public_Data_Releases/TAIR_Data_20230930/TAIR_Data_20230930/Locus_Germplasm_Phenotype_20230930.txt.gz

BITACORA-用于鉴定和注释基因组组装中的基因家族的综合工具，2020年发表于Molecular Ecology Resources，至今65引用，github 42星。懒得试了

当在rstudio-server中使用BiocManager::install安装软件，但是报错找不到gcc、gfortran等编译器时，使用以下命令修正：

Sys.setenv(PATH = paste(Sys.getenv("PATH"), "/home/caigui/mambaforge/envs/r_latest/bin", sep=":"))

Sys.getenv("PATH")

更新mamba

从v1.4.?更新到了v1.5.10，虽然现在官方不推荐这种安装方法了 ……

mamba activate base

conda update mamba -n base --override-channels -c conda-forge

一个压缩程度适当的pdf在线压缩网站……

https://www.ilovepdf.com/

突然发现docker pull用不了了，查了查才发现被封了……

Arm版本Mac，安装x86_64版本的R时，目前会导致Positron这个IDE无法启动R，根据github.com/posit-dev/positron/issues/3070，这是个待修复的BUG

seurat v4版本的文件可以在v5版本上正常umapplot，但v5版本的文件不能在v4版本上使用umapplot。不错，起码向下还兼容了

服务器给mac使用scp传输文件，需要打开mac的通用-共享-远程登录，否则会报22端口的Connection refused