CaiGui's blog

TAIR突变体表型汇总下载地址：https://www.arabidopsis.org/download/file?path=Public_Data_Releases/TAIR_Data_20230930/TAIR_Data_20230930/Locus_Germplasm_Phenotype_20230930.txt.gz

BITACORA-用于鉴定和注释基因组组装中的基因家族的综合工具，2020年发表于Molecular Ecology Resources，至今65引用，github 42星。懒得试了

当在rstudio-server中使用BiocManager::install安装软件，但是报错找不到gcc、gfortran等编译器时，使用以下命令修正：

Sys.setenv(PATH = paste(Sys.getenv("PATH"), "/home/caigui/mambaforge/envs/r_latest/bin", sep=":"))

Sys.getenv("PATH")

更新mamba

从v1.4.?更新到了v1.5.10，虽然现在官方不推荐这种安装方法了 ……

mamba activate base

conda update mamba -n base --override-channels -c conda-forge

一个压缩程度适当的pdf在线压缩网站……

https://www.ilovepdf.com/

突然发现docker pull用不了了，查了查才发现被封了……

Arm版本Mac，安装x86_64版本的R时，目前会导致Positron这个IDE无法启动R，根据github.com/posit-dev/positron/issues/3070，这是个待修复的BUG

seurat v4版本的文件可以在v5版本上正常umapplot，但v5版本的文件不能在v4版本上使用umapplot。不错，起码向下还兼容了

服务器给mac使用scp传输文件，需要打开mac的通用-共享-远程登录，否则会报22端口的Connection refused

在mac上通过修改vim ~/.Renviron，添加R_MAX_VSIZE=100Gb，可以解决pheatmap画图中的Error: vector memory exhausted (limit reached?)报错